اکثر رودهای ارمنستان یا به طور مستقیم به رود ارس ریخته و از طریق آن نهایتاً به دریاچه خزر سرازیر میشوند و یا از طریق رودهای کورا یا آخوریان به رود ارس میریزند. مهمترین رودهایی که در ارمنستان جریان دارد عبارتند از: رود کورا که از گرجستان سرچشمه گرفته و از طریق رود ارس به دریاچهٔ خزر میریزد، رود آخوریان که در مرزهای ارمنستان با ترکیه جریان داشته و حدود ۴۸۰ کیلومتر طول دارد، رود هرازدان که از پایتخت ارمنستان یعنی شهر ایروانمیگذرد و حدود ۱۵۰ کیلومتر طول دارد، رود آرپا که به دریاچه سوان وصل میشود و حدود ۱۳۰ کیلومتر درازا دارد و رود وروتان یا بارگیوشات که ۱۸۰ کیلومتر طول درا و یکی از مهمترین رودهای ارمنستان است.
سرچشمه رودهای ارس، کورا، زاب بزرگ (شاخه چپ رودخانه دجله) و فرات در فلات ارمنستان قرار دارد.
دریاچههای مهم فلات ارمنستان عبارتند از: سوان و وان.
دریاچه سوان در شرق ارمنستان واقع شده است و نقش بسیار چشم گیری در اکوسیستم منطقه ایفا میکند و چون در ارتفاع ۱۹۲۴ متری از سطح دریا قرار گرفته، یکی از مرتفعترین دریاچههای آب شیرین بزرگ جهان است. مساحت کلی این دریاچه ۵۲۵ مایل مربع است و از آب این دریاچه برای تأمین نیروی الکتریسیته و هم چنین آب شیرین مصرفی شهرها و زراعت استفاده میشود.
دیگر دریاچه ارمنستان، دریاچه آرپی است که در شمالشرقی این کشور در استان شیراک واقع شده و مساحت آن ۲۲ کیلومترمربع است.